wordpress3.0から「アイキャッチ画像」という機能が追加されました。
アイキャッチ機能を使ってページ毎にヘッダ画像を変更する方法です。

１．アイキャッチ機能を有効にするには、functions.phpの一番上?phpの下に下記を追加します。

// サムネイル画像の表示設定
add_theme_support('post-thumbnails');
set_post_thumbnail_size(1040, 470, true); //1.ヘッダ画像
add_image_size('mainimg', 300, auto, true);　//2.任意のサイズ

２．header.phpの画像を表示したい場所に下記を追加

 <?php the_post_thumbnail('thumbnail'); ?>　//set_post_thumbnail_size(1040, 470, true); //1.ヘッダ画像の場合
<img src="<?php echo catch_that_image(); ?>"/>　//2.任意のサイズ

３．後は、ページの編集ページの右端に「アイキャッチ画像を設定」ボタンが追加されているはずなのでそこで画像をupロードします。

４．アイキャッチが登録されていない場合は任意の画像を分岐で表示

<?php if(have_posts()): while(have_posts()): the_post(); ?>
    <?php if (has_post_thumbnail()) : ?>
        <a href="<?php the_permalink(); ?>"><?php the_post_thumbnail('thumbnail'); ?></a>
    <?php else : ?>
        <a href="<?php the_permalink(); ?>"><img src="<?php bloginfo('template_url'); ?>/img/noimage.gif" width="100" height="100" alt="デフォルト画像" /></a>
    <?php endif ; ?>
<?php endwhile; endif; ?>

５．カスタム投稿タイプでアイキャッチを表示。
functions.phpに下記を追加

register_post_type(
    'event',　//カスタム投稿タイプ名
    // 'supports'に'thumbnail'を追記
    array('supports' => array('title','editor','thumbnail'))
);